O projeto Articula Escolas integra as iniciações científicas dos estudantes do Ensino Médio das escolas públicas e particulares no contexto universitário. A parceria universidade-escolas se concretiza na orientação conjunta de pesquisadores da Unifesp e professores da educação básica.

Os principais diferenciais do Articula Escolas, comparativamente à proposta de iniciação científica do Ensino Médio implementada pelo Governo Federal são: